两种更可怕的变体成为美国新冠病例的主流变种。Alpha 变种——最早在英国发现的 B.1.1.7——传染性比 SARS-CoV-2 高约 50%， 在数个月之中就成为美国最流行的变种，截至四月底占到了新冠病例的七成。但最新数据显示，最早在印度发现的 B.1.617.2 变种 Delta 和在巴西与日本发现的 P.1 变种 Gamma 逐渐后来居上。Delta 传染性比 Alpha 还要强 50% 到 60%，能导致更严重症状，目前英国九成的病例是 Delta。而  Gamma 虽然没有快速传播，但能削弱疫苗的效力。在美国，Alpha 变种的比例已经从七成降至 35%，而截至 6 月 9 日 Delta 和 Gamma 占 30%，其中 Delta 占 14%，Gamma 占 16%。截至 6 月 19 日最新数据中，Delta 占到了 20.6%。