现代人类携带了尼安德特人的基因，这是现代人类和尼安德特人有过跨种族交配的证据。但这种跨种交配发生在什么时候什么地点，科学家一直对此有争议。根据发表在 bioRxiv 上的一篇预印本，对古代和现代基因组的分析显示，现代人类的尼安德特人 DNA 来自于约 4.7 万年前。尼安德特人和现代人类约在 50 万年前分开，尼安德特人主要生活在欧亚大陆，而现代人类则生活在非洲。现代人类祖先大约 7 万年前离开了非洲进入欧亚大陆，可能在今天的中东或欧洲遭遇了尼安德特人。加州伯克利的科学家分析了已测序的 59 名古代智人基因组，他们生活在距今 4.5 万到 2200 年前。研究人员随后在古代智人基因组和全球 275 个现代人基因组中识别出尼安德特人 DNA 区域，跟踪尼安德特人基因随时间在古代和现代人群中的演变。他们估计尼安德特人基因是在大约 4.7 万年前进入到现代人类祖先基因组中的。